Né le 18 mars 1982 à Saint-Denis de la Réunion, il prend des cours de violon de 1986 à 1993, avant d'opter pour le Saxophone.
Dès 1995, il joue du Ténor au sein du Big-Band du Conservatoire d'Antibes, où il habite alors, et intègre en 1997 le Conservatoire National de Région de Nice, où il étudie le Saxophone classique et la musique contemporaine avec François Leclaircie.
En 1999, il obtient le Baccalauréat Général avec mention et vient suivre à Paris le cursus de l'American School of Modern Music. Pendant cinq ans, il y travaille le Saxophone, l'harmonie, l'arrangement et la composition, et écrira aussi bien pour Big-Band que pour Quatuor à cordes. Il aura également l'occasion d'y rencontrer des musiciens prestigieux, tels Charles Lloyd,

Johnny Griffin ou encore David Liebman, qui lui remettra son Diplôme en 2004.
Parallèlement à ses études, il mène une vie professionnelle active, puisqu'il joue dans de nombreux groupes et orchestres de tous styles: Big-Band, chanson, Jazz, salsa, swing... En 2002, il est co-fondateur d'un projet, "La Brocante", avec qui il enregistre un disque en 2003 et donnera des concerts en France et au Maroc.
En 2004, il intègre le CMDL (Centre des Musiques Didier Lockwood), où il étudie auprès d'André Villéger, Pierrick Pedron, Stéphane Guillaume, Sylvain Beuf, Eric Barret, Nicolas Dary et Fred Borey, et rencontre de nombreux autres musiciens avec qui il travaille depuis régulièrement. Ainsi, en 2005 il prend part au projet Electro-Jazz "Blözar" et monte son propre quartet: "Etienne Bouyer Group".
En 2006, il est diplômé du CMDL et fait deux séjours à New-York. Il y prend des cours avec David Liebman et Sam Newsome et rencontre de nombreux musiciens, comme Mike Rivett, Lou Grassi, Russ Lossing ou encore Rez Abassi. En septembre de cette même année, il participe à une Master-Classe d'une semaine avec Charlie Haden et commence à travailler avec la violoniste belge Cécile Broché. La collaboration avec cette dernière aboutira à deux projets distincts: Cécile Broché/Etienne Bouyer Duo (disque à paraître en octobre 2008 sur le label Igloo), et en 2007 Cécile Broché/Etienne Bouyer Quartet, avec Martin Berauer à la basse électrique et Emile Saubole à la batterie.
De 2006 à 2008, il étudie au CNR de Paris et au Conservatoire Royal de Bruxelles avec Jean-Charles Richard, Emil Spanyi, Pierre Bertrand, Steve Houben, Fabrice Alleman et Michel Hatzigeorgiou, et obtient en 2008 le DEM Jazz. Durant cette période, il participe à des Master-Classes avec Bob Mintzer, François Jeanneau, David Friedman, Peter Herbert, Denis Leloup, Pierrick Hardy et Pierre Marcault, ainsi qu'à des stages d'écriture à Bruxelles avec le compositeur anglais John White, qui aboutiront à la création du collectif belge COAC (Collective Of Active Composing), dont il est membre.
Depuis 2006, il enseigne le Saxophone et l'improvisation jazz, participe à des sessions d'enregistrement (CORTES) et joue et écrit pour de nombreux projets.
Le 12 mai dernier, il a remporté le Tremplin Jeunes Talents du festival Jazz à Saint-Germain-des-Prés 2008 avec le groupe "Yuval Amihaï Ensemble".